Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00312Q9Y6C7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms