Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFG3L2Q9Y4W6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFG3L2Q9Y4W6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms