Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RAPGEF2Q9Y4G8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RAPGEF2Q9Y4G8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF2Q9Y4G8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF2Q9Y4G8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF2Q9Y4G8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF2Q9Y4G8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF2Q9Y4G8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF2Q9Y4G8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RAPGEF2Q9Y4G8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms