Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SH3BP1Q9Y3L3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1Q9Y3L3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms