Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COQ4Q9Y3A0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ4Q9Y3A0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms