Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZDHHC9Q9Y397 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDHHC9Q9Y397 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDHHC9Q9Y397 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms