Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL20Q9Y2M5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms