Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM2AQ9Y2K7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM2AQ9Y2K7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms