Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP20Q9Y2K6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP20Q9Y2K6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms