Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms