Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOBEC2Q9Y235 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC2Q9Y235 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms