Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHF8Q9UPP1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHF8Q9UPP1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms