Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
L1RE1Q9UN81 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
L1RE1Q9UN81 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms