Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZMYND8Q9ULU4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZMYND8Q9ULU4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms