Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNRF3Q9ULT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNRF3Q9ULT6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNRF3Q9ULT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms