Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PNMA3Q9UL41 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNMA3Q9UL41 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms