Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSL6Q9UKU0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACSL6Q9UKU0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms