Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C4Q9UKN8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms