Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP8AP2Q9UKL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP8AP2Q9UKL3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms