Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCP2D1Q9UJQ7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms