Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYTH4Q9UIA0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYTH4Q9UIA0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms