Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPC1L1Q9UHC9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPC1L1Q9UHC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPC1L1Q9UHC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms