Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO40Q9UH90 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms