Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT8Q9UFF9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms