Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KLHL13Q9P2N7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL13Q9P2N7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms