Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP28Q9P2N2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP28Q9P2N2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms