Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP35Q9P2H5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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