Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EHD3Q9NZN3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EHD3Q9NZN3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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