Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PODXL2Q9NZ53 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PODXL2Q9NZ53 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms