Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA3Q9NZ52 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA3Q9NZ52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA3Q9NZ52 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms