Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18AQ9NYP9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms