Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM28Q9NW13 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM28Q9NW13 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms