Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO28Q9NVF7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO28Q9NVF7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms