Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC87Q9NVE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC87Q9NVE4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC87Q9NVE4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC87Q9NVE4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC87Q9NVE4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC87Q9NVE4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC87Q9NVE4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC87Q9NVE4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms