Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TDP1Q9NUW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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