Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPMQ9NSP4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms