Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SALL1Q9NSC2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms