Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOPORSQ9NS56 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOPORSQ9NS56 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOPORSQ9NS56 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms