Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SERINC1Q9NRX5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SERINC1Q9NRX5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms