Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB6BQ9NRW1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms