Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN4Q9NRL3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms