Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDLIM7Q9NR12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms