Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EXOSC3Q9NQT5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms