Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPRD1BQ9NQG5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms