Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCRT2Q9NQ03 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms