Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX8Q9HC52 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms