Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3GQ9HC16 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms