Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP29Q9HBJ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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