Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBF2Q9HAK2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms