Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LIN28AQ9H9Z2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LIN28AQ9H9Z2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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